Mgr Smaragde Mbonyintege est né le 2 février 1947 à Rutobwe-Gitarama (Kabgayi). Il a fait ses études primaires et secondaires chez les Frères des Ecoles chrétiennes, également au petit séminaire de Kigali.
Puis il est entré au grand séminaire de Nyakibando où il a fait ses études de philosophie (1969-1972) et sa théologie (1972-1975).
Il a été ordonné prêtre en1975 pour le diocèse de Kabgayi.
Après différentes charges pastorales, il a été recteur du petit séminaire Saint-Jean (1978-1989), avant de partir à Rome où il obtint, à l’université pontificale grégorienne, une maîtrise en théologie spirituelle (1979-1983); il a ensuite enseigné et été directeur spirituel et vice-recteur au grand séminaire de Nyakibanda, puis professeur à l’inter-noviciat de Butare (1983-1997).
Depuis 1997 il était recteur du grand séminaire Nyakibanda, et, depuis 2003 directeur de la revue de spiritualité et de théologie « Urumuri Kristu » (Lumière du Christ).
