Plusieurs papes ont eu une sollicitude particulière pour les apparitions de Fatima et pour ses fameux « secrets », indique le blog proche du Saint-Siège Il Sismografo. Trois papes sont déjà venus en pèlerinage à Fatima : Paul VI (1967), Jean-Paul II (1982, 1991 et 2000), et Benoît XVI (2010). Le pape François sera le quatrième à s’y rendre les 12 et 13 mai 2017, pour canoniser les deux pastoureaux voyants Francisco et Jacinta.
Les apparitions de la Vierge ont eu lieu sous le pontificat du pape Benoît XV, élu le 3 septembre 1914. Huit jours après la première apparition de la Vierge de Fátima en 1917, Benoît XV s’adresse avec une prière particulière à la Vierge pour demander la paix. Le pape veut que le monde, déchiré par la Première Guerre mondiale, « recoure au Cœur de Jésus, trône de grâces et que l’on fasse appel à ce trône par le moyen de l’intercession de Marie » et il demande pour cela que l’invocation « Reine de la paix, priez pour nous » soit ajoutée de manière permanente dans la Litanie de Lorette.
Quelques mois plus tard, le 17 janvier 1918, le pape Benoît XV refonde l’ancien diocèse de Leiria, au Portugal. Le 29 avril de la même année, dans une lettre adressée aux évêques du Portugal sur les apparitions de Fatima, il écrit qu’il s’agissait d’une « aide extraordinaire de la Mère de Dieu ».
En 1929, le pape Pie XI, au cours de sa visite au Collège portugais, offre aux séminaristes une reproduction de la Vierge du Rosaire de Fatima. Le 1er octobre 1930, l’indulgence partielle est accordée à ceux qui visitent personnellement le sanctuaire et qui prient pour les intentions du pape ainsi qu’une indulgence plénière une fois par mois à ceux qui sont allés à Fatima en groupe. Avec l’accord de Pie XI, le 13 octobre 1930, l’évêque da Silva (de Leiria) annonce, dans une lettre pastorale, les résultats de l’enquête officielle sur Fatima et affirme que le culte de la Vierge de Fatima est désormais officiellement possible.
Le 13 juin 1940, le pape Pie XII, depuis toujours très lié à Fatima, parle pour la première fois des apparitions dans l’encyclique « Saeculo Exeunte », adressée aux catholiques du Portugal. En octobre 1942, il consacre le monde au Cœur immaculé de Marie, avec une mention particulière pour la Russie. Le 11 octobre 1954, il publie une encyclique sur le « Règne de Marie » (‘Ad caeli Reginam’) et s’y réfère à la statue miraculeuse de Fatima.
En 1964, pendant le Concile Vatican II, au cours des cérémonies solennelles de clôture, le pape Paul VI renouvelle la consécration du monde au Cœur immaculé de Marie effectuée par Pie XII. Il annonce qu’il enverra un émissaire spécial à Fatima pour apporter une rose dorée, don symbolique pour le sanctuaire de Fatima. Le 13 mai 1965, par l’intermédiaire de son légat pontifical, Paul VI offre la « rose dorée », confiant toute l’Église aux soins maternels de la Vierge. Le 13 mai 1967, à l’occasion du cinquantième anniversaire de la première apparition, Paul VI se rend en pèlerinage au sanctuaire de la Vierge de Fatima.
Le pape Jean-Paul II, qui visite à trois reprises le lieu des apparitions, affirme lors de son premier pèlerinage, le 12 mai 1982 : « Je suis au Portugal pour réaliser un rêve caressé depuis longtemps, en tant qu’homme d’Église et désireux de connaître directement Fatima ».
Avec une traduction de Constance Roques
